6月7日，疫情指揮中心至今已成立140天，開了164場記者會。因應疫情趨緩，未來記者會改為一週一次，訂於每週三下午2時舉行[212]。衛生福利部整合中央及地方政府各項防疫政策的決策過程，並將此「臺灣模式」以網站「COVID-19臺灣防疫關鍵決策網（页面存档备份，存于互联网档案馆）」呈現，向民眾及各國說明臺灣防疫成功因素、衛生醫療體系基礎、重大政策等[213][214]。交通部對多項管制措施進行鬆綁，台鐵連續假期可賣站票但有數量限制；高鐵可賣自由座；車廂、班機內恢復販售飲食與商品；觀光景區和遊樂區取消人數及車輛限制[215]。車站、捷運進站仍須量體溫，但保持社交距離下可脫口罩。電影院無需梅花座、人數不受限制，保持安全距離，可以不戴口罩[216]。中華職棒座位採間隔梅花座但人數不受限制，保持安全距離，可以不戴口罩，現場可以飲食、販賣食物[217]。指揮中心例行記者會改為每周三召開[218]。
6月17日，考量長期隔離治療對個案身心之影響及醫療資源使用之適當性，經參考國際作法及相關研究實證並諮詢專家後，將現行確診個案解除隔離條件，由連續3次呼吸道檢體檢驗陰性，調整為連續2次檢驗陰性即可解除隔離[219]。境外確診個案須符合：(1)發病日至登機日已逾2個月，且症狀已緩解、(2)距發病日已達10天，且取得2次呼吸道檢體檢驗SARS-CoV-2陰性證明(須間隔至少24小時採檢)，條件之一才能搭機抵達台灣，違者將處新臺幣1萬元以上15萬元以下罰鍰[220]。
6月19日，放寬醫療院所人員管制措施，每日開放探視時段增至2個，不限病房科別，但須全程配戴口罩，且至多2名訪客，盡量避免不必要的探視，以降低感染風險[221]。
6月22日，短期商務人士入境，可有條件申請縮短居家檢疫時間至5~7日[222]。
6月25日，開放桃園機場轉機，但排除疫情仍屬嚴峻的中國大陸，並僅能搭乘同一航空集團營運的航班(華航、長榮及國泰航空)，且限制轉機停留時間在8小時以內[223]。
6月29日，外籍人士除觀光、一般社會訪問以外，得提出申請入境；港澳人士有特殊人道考量、緊急協處、商務履約、跨國企業內部調動及商務經貿交流(含工作居留、投資居留及創新創業居留等)之需求，或已取得居留證之外籍配偶、子女，得提出申請入境。但仍應主動出示「表訂登機時間前3天內之COVID-19核酸檢驗陰性報告(英文版)」，並配合入境後居家檢疫14天及必要之檢疫措施[224]。
6月30日，中央流行疫情指揮中心發言人莊人祥表示，口罩徵用政策將延長到今年12月底，口罩實名制政策也將繼續辦理[225]。
7月8日，放寬居家隔離/檢疫者奔喪或探視之次數及時間，隔離/檢疫5天後無症狀且檢驗陰性者，經醫院同意後由地方衛生單位安排外出，無論探病、奔喪或辦理喪事均以每天1次、每次2小時為原則，期間不得搭乘大眾交通工具，需全程佩戴口罩並保持安全社交距離[226]。
7月15日，逾期未領實名制口罩的民眾可至原指定通路及門市補領，處理費及簡訊等相關費用則由民眾自行負擔[227]。
7月16日，台灣人之2歲(含)以下持居留證的中國大陸籍子女申請入境，並得由父母親陪同，入境後須依規定完成14天居家檢疫[228]。
7月24日，交通部觀光局宣布〈暫停旅行業組團赴國外旅遊及接待來台觀光團體入境措施〉將再持續實施至8月31日，並視後續疫情發展適時調整公告事宜[229]。
7月26日，自菲律賓飛抵台灣的旅客中，台灣人及持居留證或居留簽證、移工、境外生、外交公務等外國籍人士，無論有無症狀，入境時均須於機場完成採檢，有症狀者送至集中檢疫所等候檢驗結果，無症狀者返家或至防疫旅館完成居家檢疫14天。未持有臺灣居留證之外國籍人士，仍須提供登機前3日內之COVID-19檢驗陰性報告，才能登機、轉機及入境台灣，並於入境後進行居家檢疫14天[230]。
8月1日，除健康檢查、美容醫學等非急迫性醫療需求外，國際醫療病患可透過醫療機構檢具相關資料、文件提出赴台就醫申請。可申請其配偶或3親等內親屬2人陪同，必要時得增加1位居住國的醫事人員或其他照護者隨行，需附醫療保險證明、檢疫切結書、入境健康證明[231]。
8月5日，部分場所回復戴口罩規定。
8月12日，自菲律賓飛抵台灣的旅客均需於集中檢疫場所接受檢疫14天[232]。
8月13日，6歲以下中國大陸籍子女及其陪同父母均得返臺，入境後須依規定完成14天居家檢疫[233]。
8月17日，彰化縣衛生局長葉彥伯主動採驗無症狀居家檢疫者，而後被檢疫者確診，由於不符合指揮中心篩檢作業程式，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中同日下令政風處調查採檢流程是否符合程序及採檢理由，引發爭議[234][235]。